針對媒體報導部分參加100學年度北北基申請入學錄取學生反映其錄取學校與心目中理想學校有落差乙節，教育局表示，可以理解和體會這些同學的感受，也確實需要檢討，刻正循各種管道及方法蒐集資料，教育局將於一週內，邀集其他二市教育局處代表及各招生委員會的主委學校，針對今年度「北北基申請入學錄取學生反映錄取學校與理想學校分數落差問題」，召開會議進行檢討，作為明年辦理及規劃的重要參考。
教育局表示，今年申請入學與登記分發出現的分數落差，大多出現在社區高中，可能的原因除部份學校申請入學門檻的設定較高外，還有名額回流的問題，今年的免試入學、申請入學等管道報到後約仍有2萬8千多招生缺額，最後均回流至登記分發，在6月13日公佈的登記分發招生人數增加到了約5萬多名。因此，最後使得考生得以於登記分發中，相對容易錄取，而致錄取分數變低，出現與申請入學錄取分數落差的現象。
此外，教育局強調，減輕學生升學壓力，是舉辦「北北基聯測」的目的，教育局持續朝向「減輕學生升學壓力」目標持續規劃。
教育局表示，配合教育部12年國民基本教育的推動，近年來積極辦理高中職均、優質化等各項工作，提升各校軟硬體設施，在多年耕耘下北市每所高中職皆是明星學校，均各有其辦學優點及特色。北北基高中職申請入學、登記分發入學等招生階段均已完成，希望已透過各管道入學報到的同學能認同所選，在未來的三年安心學習，好好充實自我，一展長才。